病原微生物宏基因组 mNGS 检测是一种通过分析基因信息来辅助体质决策的医学检测手段，在港澳已有多家正规机构开展此项服务项目。
这个检测查什么
本检测使用宏基因组高通量DNA测序（mNGS）技术，对临床样本中的全部病原体基因组完成无偏倚测序。技术程序包括样本前处理、核酸提取（DNA+RNA同步）、cDNA合成、片段化、文库构建、高通量测序及生物信息分析。检测范围覆盖31,033种微生物，具体包括：细菌14,208种（含104种分枝杆菌）、真菌814种、病毒15,720种（DNA病毒12,894种+RNA病毒2,826种）、寄生虫169种、支原体/衣原体97种、螺旋体25种。协同检测4,417种耐药基因（覆盖31种抗生素）和484种毒力基因。该技术不依赖病原体分离培养，可检出丰度较低甚至痕量病原体，特别适用于传统检测阴性但临床高度怀疑感染的疑难病例。局限性在于无法区分定植与致病，可能受样本污染影响，且未知或新发病原体可能漏检。
检测适用对象
- 重症肺炎受检者经常规抗生素治疗3天无效，需快速明确病原体
- 不明原因发热（FUO）常规检查无明确病因，高度怀疑感染
- 免疫缺陷患者（HIV、化疗后、器官移植）疑似机会性感染
- 中枢神经系统感染脑脊液常规阴性但临床高度怀疑病原体
- ICU复杂感染病情进展迅速，传统培养检测周期无法满足临床决策
- 疑似罕见或难培养病原体（如分枝杆菌、立克次体、放线菌）感染
检测结果是否靠谱
检测准确性依赖于宏基因组测序技术的深度与数据库的完整性。本检测采用自行研发的数据库，覆盖31,033种微生物及4,417种耐药基因，基于《ABX指南》和《临床微生物学手册（第11版）》进行解读。检出结果需结合临床症状、影像学及其他实验室检查综合判断。阳性结果需区分定植、污染与真正病原；阴性结果不能完全排除感染，可能因样本中病原量过低、抗生素治疗后或新发病原体未列入数据库。耐药基因检测可引导抗生素决定，但最终药敏试验仍需传统培养确认。
样本采集便捷，根据感染部位选择相应类型：外周血、痰液、肺泡灌洗液、脑脊液、尿液、分泌物等均可。无需空腹，常规采样流程。本地实验室接收样本后，结果报告周期为3天。支持寄送样本，具体采样容器及运输条件请咨询客服。对于重症急诊场景，可与实验室确认加急流程，最快24-48小时出报告。
项目详情
项目分类: 病原感染检测
样本类型: 血液/痰液/肺泡灌洗液/脑脊液/尿液/分泌物
检测方法: 宏基因组高通量测序
临床用途: 快速识别细菌/真菌/病毒/寄生虫等病原体,适用于重症感染、不明原因发热、免疫缺陷患者感染、ICU 复杂感染
报告周期: 3天
参考价格: 3500元（2026年更新）
检测步骤详解
- 临床医生评估患者是否符合mNGS检测适应症，开单申请
- 根据感染部位采集相应样本（血液/痰液/肺泡灌洗液/脑脊液/尿液/分泌物等）
- 样本在{ city }本地或通过冷链物流寄送至检测实验室
- 实验室进行样本前处理（裂解病原细胞壁）及核酸提取（DNA+RNA同步）
- 合成cDNA（将RNA反转录为互补DNA），进行片段化与文库构建
- 采用高通量测序平台进行宏基因组测序，获取海量序列数据
- 生物信息学分析：将测序reads比对至31,033种微生物数据库及耐药基因库
- 专精团队结合临床信息进行报告解读与审核，3天内出具正式报告
港澳病原微生物宏基因组 mNGS 检测机构推荐
广东其他病原微生物宏基因组 mNGS 检测机构：
港澳三甲医院参考
1. 深圳大学第三附属医院
地址: 广东省深圳市罗湖区友谊路47号
电话: 0755-82203083
资质: 三级甲等 / 综合医院
2. 广东省第二人民医院
地址: 广州市白云区机场路290号
电话: 020-28286666
资质: 三级甲等 / 综合医院
3. 南方医科大学第三附属医院
地址: 广州市天河区中山大道西183号
电话: 020-62784120
资质: 三级甲等 / 综合医院
4. 中山市小榄人民医院
地址: 中山市小榄菊城大道中段65号
电话: 0760-88662120
资质: 三级甲等 / 综合医院
热门疑问
问: 报告显示有‘脓肿分枝杆菌’，这个病好治吗？
脓肿分枝杆菌是快速生长的非结核分枝杆菌，多重耐药，普通抗生素通常无效。报告显示其携带耐药基因，如aph(3')-IIa，指导用药如克拉霉素、阿奇霉素、替加环素。疗程较长，需在医生指导下联合用药，不可自行停药。mNGS能快速识别这类难培养病原，为治疗争取时间。
问: 我在港澳，怎么获取专用采样管？
您可联系我们的客服人员，提供您的城市和地址信息，我们会安排将专用采样包（含采样管、冰袋、运输箱、填写单）快递到您手上。采样包免费提供，您只需支付检测费用。收到后按说明书采样，并尽快联系快递上门取件寄回实验室即可。
问: 报告说检出‘耐药基因’，但药敏还没出，我能先换药吗？
不建议自行换药。耐药基因（如aph(3')-IIa）提示潜在耐药风险，但mNGS检测的4,417种耐药基因基于基因序列，与实际表型药敏存在差异。例如脓肿分枝杆菌虽多重耐药，仍需药敏确认具体敏感抗生素（如克拉霉素、替加环素）。请等待完整药敏报告。
问: 我查出来有病毒，这个检测能区分是DNA病毒还是RNA病毒吗？
可以。本检测采用DNA+RNA同步测序技术，单独进行一次检测就能同时覆盖DNA病毒（如巨细胞病毒）和RNA病毒（如流感、新冠）。数据库中包含15,720种病毒，其中DNA病毒12,894种，RNA病毒2,826种。
问: 我父亲在港澳ICU，因重症肺炎上呼吸机，用了多种抗生素没好转，痰培养一直阴性，这个检测能帮上忙吗？
非常适合ICU复杂感染。常规培养在抗生素使用后阳性率显著下降，而mNGS受抗生素影响较小。本检测覆盖31,033种病原体，包括真菌814种、病毒15,720种，还能检出4,417种耐药基因，指导精准用药。报告周期仅3天，比传统培养更快，适合病情进展迅速的重症患者。
问: 我在港澳，报告里说检出多种病原体，但我症状单一，这是污染吗？
检出多种病原体可能代表混合感染，也可能存在定植或样本污染。我们的数据库覆盖31,033种微生物，能同时识别细菌、真菌、病毒等。需结合各病原的reads数、临床特征及背景菌判断。例如低reads数（<10）且无相关症状的病原，更可能是污染或定植。
问: 报告里同时列出好几种病原体，到底哪个才是真正的致病菌？
需结合临床综合判断。我们的判读原则是：①看reads数（高reads的病原更可能是致病菌）；②看病原类型（通常致病性强的如脓肿分枝杆菌、烟曲霉更需重视）；③看临床特征（如ICU肺炎患者，铜绿假单胞菌可能性大；而α乳头瘤病毒7型可能是皮肤定植）。医生会结合您的情况确定主次。
问: 我是一名化疗的癌症患者，最近高烧不退，查不出感染源，能做这个检测吗？
非常合适。化疗后免疫力低下，容易发生机会感染。本检测覆盖31,033种病原体（含真菌、病毒），且不依赖培养，即使常规检查阴性，也能快速锁定病原，指导精准用药。报告周期3天，价格3500元。
检测前后须知
- 本检测应在临床高度怀疑感染且常规检测阴性时考虑，不作为一线筛查
- 检测结果需结合临床表现、影像学及其他检查综合判读，不可单独诊断
- 检出病原体可能为定植或污染，需由临床医生评估致病性
- 阴性结果不能完全排除感染，需警惕病原量过低或新发病原体
- 样本采集应严格无菌操作，避免污染影响结果准确性
- 抗生素治疗可能影响检出率，但影响程度小于传统培养
- 耐药基因检测结果可指导用药，但最终药敏试验仍需培养确认
- 报告周期为3天，重症急诊可咨询加急流程
